Zaštićena područja jedno su od najznačajnijih prirodnih vrijednosti u Republici Hrvatskoj u smislu biološke i krajobrazne raznolikosti, a svrstana su po kategorijama. Jedna od tih kategorija su nacionalni parkovi, a među najistaknutijim predstavnicima je Nacionalni park Plitvička jezera koji se nalazi i na UNESCO-voj Listi svjetske prirodne baštine. Svojim specifičnim reljefom, slapištima, jezerima i velikim brojem predstavnika flore i faune ne odaje dojam da je pod teretom i svakodnevnim sve većim pritiskom različitih onečišćujućih tvari koje mnogim putovima dospijevaju u njegov okoliš. Općenito, problem onečišćenja okoliša globalni je problem današnjice i može imati dalekosežne negativne posljedice po prirodu, biljni i životinjski svijet te na zdravlje ljudi. Iz tog razloga potrebno je sustavno praćenje kvalitete sastavnica okoliša koje se vrši putem mjerenja koncentracija onečišćujućih tvari i stavljanjem njihovih vrijednosti u odnos sa zakonski propisanim graničnim vrijednostima. U ovome radu, kroz analizu rezultata monitoringa mikrobioloških parametara odgovornih za kvalitetu površinskih kopnenih voda i rezultate praćenja onečišćujućih tvari u zraku, lebdećih čestica, na točno određenim primjerima, bit će prikazana kvaliteta vode i zraka na području Nacionalnog parka Plitvička jezera.